Ratchet e Clank estão desfrutando da Metropolis no planeta Kerwan, quando Capitão Qwark informa a eles um sinal de perigo, de uma emboscada do ataque espacial robótico. A ligação é cortada, e agora a dupla se vê em meio de uma ampla escala de invasão liderada pelo Imperador Percival Tachyon, sendo conhecido como um "Cragmite".