Risk of Rain é um jogo de plataforma com elementos randomizados. O jogo ocorre num futuro distante, onde transporte espacial é comum. Trens espaciais carregam passageiros e mercadorias por todo o espaço. Porém, uma nave em particular carregava algo especial. Após uma série de eventos infelizes, este trem recebe um tiro que o leva para fora da órbita e aterrisa em um misterioso planeta... com um sobrevivente.