Após a destruição de Copy X e da sede da Neo Arcadia, Zero lutou contra Neo Arcadianos por meses. Harpuia o resgata e o leva para a resistência ao encontá-lo. Ao chegar lá, se depara com Ciel trabalhando numa energia alternativa para solucionar a crise energética, motivo inicial para o genocídio cometido pela Neo Arcádia. Elpizo, novo comandante dos exércitos da Resistência, começou um plano para acabar de vez com Neo Arcadia.